《本草万方针线》简称《万方针线》，别称《本草验方针线》，共八卷。由清初医家蔡烈先于顺治九年（1652年）编辑完成。有研究者称该书为现存最早中医古籍索引，还有人称之为中国第一部科技索引。

《本草万方针线》将《本草纲目》中所附的单方（包括全部附方以及发明项下的个别处方）15000余首，按病症分类编成索引。分为通治部、外科、女科、儿科、上部、中部、下部共七部，105门。每一病症均记明该书的卷、页数。是《本草纲目》有关病症治疗方剂的一种检索工具书。现存多种清刻本和石印本。